O aprendizado nesse nível de ensino acontece por meio aulas expositivas, saídas pedagógicas, aulas práticas em laboratórios modernos e projetos diferenciados, o que permite ao aluno do Colégio Santo Antônio o aprendizado dinâmico e a consolidação do hábito de estudo.

O Colégio Santo Antônio utiliza o Sistema Positivo de Ensino (SPE), adotado por escolas de todo Brasil. O SPE é atualizado por um centro de pesquisas próprio, no qual especialistas analisam tendências e atualizam as ferramentas de ensino, para tornar o aprendizado mais prazeroso. Nossa proposta é formar cidadãos responsáveis e conscientes do seu papel na sociedade.